Protein–RNA interactions for Protein: P54886

ALDH18A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH18A1P54886 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH18A1P54886 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALDH18A1P54886 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALDH18A1P54886 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH18A1P54886 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ALDH18A1P54886 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH18A1P54886 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH18A1P54886 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH18A1P54886 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH18A1P54886 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH18A1P54886 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH18A1P54886 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH18A1P54886 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms