Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EMP3P54852 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EMP3P54852 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EMP3P54852 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EMP3P54852 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMP3P54852 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMP3P54852 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMP3P54852 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMP3P54852 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMP3P54852 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EMP3P54852 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EMP3P54852 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EMP3P54852 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EMP3P54852 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EMP3P54852 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMP3P54852 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EMP3P54852 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EMP3P54852 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMP3P54852 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMP3P54852 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMP3P54852 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMP3P54852 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMP3P54852 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMP3P54852 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMP3P54852 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EMP3P54852 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EMP3P54852 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EMP3P54852 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EMP3P54852 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EMP3P54852 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EMP3P54852 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMP3P54852 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMP3P54852 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EMP3P54852 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMP3P54852 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMP3P54852 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMP3P54852 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMP3P54852 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EMP3P54852 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EMP3P54852 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMP3P54852 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMP3P54852 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMP3P54852 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMP3P54852 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMP3P54852 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMP3P54852 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMP3P54852 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EMP3P54852 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EMP3P54852 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMP3P54852 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EMP3P54852 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EMP3P54852 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EMP3P54852 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EMP3P54852 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EMP3P54852 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMP3P54852 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMP3P54852 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMP3P54852 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMP3P54852 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMP3P54852 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMP3P54852 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMP3P54852 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EMP3P54852 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMP3P54852 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMP3P54852 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EMP3P54852 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMP3P54852 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMP3P54852 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMP3P54852 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EMP3P54852 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMP3P54852 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMP3P54852 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMP3P54852 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMP3P54852 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMP3P54852 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMP3P54852 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMP3P54852 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMP3P54852 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMP3P54852 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMP3P54852 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EMP3P54852 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMP3P54852 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMP3P54852 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMP3P54852 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMP3P54852 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMP3P54852 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMP3P54852 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMP3P54852 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMP3P54852 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMP3P54852 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMP3P54852 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMP3P54852 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMP3P54852 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMP3P54852 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMP3P54852 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EMP3P54852 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMP3P54852 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMP3P54852 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMP3P54852 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMP3P54852 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms