Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D1P54289 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA2D1P54289 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA2D1P54289 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D1P54289 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D1P54289 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CACNA2D1P54289 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D1P54289 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms