Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A1P54219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A1P54219 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A1P54219 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A1P54219 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A1P54219 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A1P54219 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A1P54219 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms