Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNP53814 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNP53814 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMTNP53814 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMTNP53814 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMTNP53814 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMTNP53814 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMTNP53814 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMTNP53814 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMTNP53814 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMTNP53814 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMTNP53814 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMTNP53814 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNP53814 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNP53814 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNP53814 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNP53814 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNP53814 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMTNP53814 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMTNP53814 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SMTNP53814 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMTNP53814 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMTNP53814 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMTNP53814 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMTNP53814 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMTNP53814 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMTNP53814 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMTNP53814 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMTNP53814 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMTNP53814 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMTNP53814 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNP53814 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNP53814 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNP53814 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMTNP53814 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMTNP53814 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMTNP53814 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMTNP53814 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMTNP53814 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMTNP53814 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMTNP53814 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMTNP53814 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMTNP53814 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMTNP53814 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMTNP53814 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMTNP53814 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMTNP53814 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMTNP53814 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMTNP53814 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMTNP53814 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMTNP53814 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMTNP53814 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMTNP53814 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMTNP53814 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMTNP53814 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMTNP53814 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMTNP53814 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMTNP53814 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMTNP53814 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMTNP53814 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMTNP53814 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMTNP53814 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMTNP53814 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMTNP53814 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMTNP53814 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMTNP53814 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMTNP53814 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMTNP53814 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMTNP53814 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMTNP53814 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMTNP53814 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMTNP53814 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMTNP53814 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMTNP53814 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMTNP53814 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SMTNP53814 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMTNP53814 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMTNP53814 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMTNP53814 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMTNP53814 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMTNP53814 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMTNP53814 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMTNP53814 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMTNP53814 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMTNP53814 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMTNP53814 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMTNP53814 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMTNP53814 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMTNP53814 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMTNP53814 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMTNP53814 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SMTNP53814 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMTNP53814 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMTNP53814 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMTNP53814 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMTNP53814 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMTNP53814 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMTNP53814 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMTNP53814 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMTNP53814 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms