Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA8P53708 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA8P53708 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGA8P53708 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA8P53708 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA8P53708 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA8P53708 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA8P53708 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms