Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCNN1BP51168 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCNN1BP51168 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCNN1BP51168 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCNN1BP51168 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCNN1BP51168 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCNN1BP51168 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms