Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE6CP51160 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE6CP51160 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE6CP51160 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE6CP51160 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE6CP51160 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE6CP51160 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE6CP51160 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms