Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB28P51157 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB28P51157 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB28P51157 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB28P51157 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB28P51157 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB28P51157 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB28P51157 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB28P51157 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB28P51157 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB28P51157 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB28P51157 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB28P51157 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB28P51157 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB28P51157 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB28P51157 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB28P51157 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB28P51157 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB28P51157 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB28P51157 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB28P51157 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB28P51157 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB28P51157 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB28P51157 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB28P51157 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB28P51157 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB28P51157 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB28P51157 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB28P51157 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB28P51157 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB28P51157 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB28P51157 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB28P51157 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB28P51157 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB28P51157 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB28P51157 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB28P51157 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB28P51157 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB28P51157 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB28P51157 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB28P51157 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB28P51157 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB28P51157 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB28P51157 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB28P51157 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB28P51157 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB28P51157 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB28P51157 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB28P51157 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB28P51157 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB28P51157 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB28P51157 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB28P51157 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB28P51157 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB28P51157 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB28P51157 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB28P51157 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB28P51157 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB28P51157 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB28P51157 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB28P51157 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB28P51157 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB28P51157 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB28P51157 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB28P51157 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB28P51157 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB28P51157 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB28P51157 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB28P51157 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB28P51157 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB28P51157 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB28P51157 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB28P51157 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB28P51157 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB28P51157 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB28P51157 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB28P51157 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB28P51157 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB28P51157 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB28P51157 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB28P51157 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB28P51157 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB28P51157 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB28P51157 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB28P51157 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB28P51157 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB28P51157 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB28P51157 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB28P51157 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB28P51157 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB28P51157 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB28P51157 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB28P51157 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB28P51157 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB28P51157 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB28P51157 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB28P51157 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB28P51157 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB28P51157 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB28P51157 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms