Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LIG4P49917 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LIG4P49917 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LIG4P49917 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LIG4P49917 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LIG4P49917 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LIG4P49917 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LIG4P49917 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LIG4P49917 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LIG4P49917 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LIG4P49917 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LIG4P49917 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIG4P49917 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIG4P49917 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIG4P49917 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIG4P49917 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIG4P49917 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIG4P49917 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LIG4P49917 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LIG4P49917 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LIG4P49917 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LIG4P49917 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LIG4P49917 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LIG4P49917 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LIG4P49917 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LIG4P49917 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIG4P49917 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIG4P49917 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIG4P49917 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIG4P49917 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIG4P49917 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIG4P49917 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LIG4P49917 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIG4P49917 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIG4P49917 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LIG4P49917 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LIG4P49917 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LIG4P49917 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LIG4P49917 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LIG4P49917 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LIG4P49917 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LIG4P49917 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LIG4P49917 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LIG4P49917 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LIG4P49917 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LIG4P49917 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LIG4P49917 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LIG4P49917 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LIG4P49917 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LIG4P49917 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LIG4P49917 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LIG4P49917 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LIG4P49917 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LIG4P49917 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LIG4P49917 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LIG4P49917 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LIG4P49917 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LIG4P49917 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LIG4P49917 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIG4P49917 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LIG4P49917 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LIG4P49917 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LIG4P49917 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LIG4P49917 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LIG4P49917 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LIG4P49917 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LIG4P49917 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LIG4P49917 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LIG4P49917 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LIG4P49917 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LIG4P49917 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LIG4P49917 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LIG4P49917 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LIG4P49917 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LIG4P49917 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIG4P49917 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIG4P49917 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIG4P49917 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LIG4P49917 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIG4P49917 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIG4P49917 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIG4P49917 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIG4P49917 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LIG4P49917 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LIG4P49917 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LIG4P49917 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LIG4P49917 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LIG4P49917 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LIG4P49917 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LIG4P49917 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LIG4P49917 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
LIG4P49917 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LIG4P49917 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms