Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HARS2P49590 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HARS2P49590 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HARS2P49590 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HARS2P49590 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HARS2P49590 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HARS2P49590 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HARS2P49590 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HARS2P49590 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARS2P49590 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARS2P49590 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARS2P49590 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HARS2P49590 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HARS2P49590 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HARS2P49590 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HARS2P49590 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HARS2P49590 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HARS2P49590 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HARS2P49590 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HARS2P49590 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HARS2P49590 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HARS2P49590 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARS2P49590 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARS2P49590 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARS2P49590 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARS2P49590 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HARS2P49590 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HARS2P49590 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HARS2P49590 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HARS2P49590 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HARS2P49590 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HARS2P49590 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HARS2P49590 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HARS2P49590 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HARS2P49590 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HARS2P49590 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HARS2P49590 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HARS2P49590 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HARS2P49590 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HARS2P49590 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HARS2P49590 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HARS2P49590 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HARS2P49590 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HARS2P49590 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HARS2P49590 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HARS2P49590 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HARS2P49590 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HARS2P49590 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HARS2P49590 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HARS2P49590 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HARS2P49590 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HARS2P49590 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARS2P49590 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARS2P49590 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARS2P49590 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARS2P49590 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARS2P49590 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARS2P49590 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HARS2P49590 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HARS2P49590 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HARS2P49590 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HARS2P49590 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HARS2P49590 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HARS2P49590 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HARS2P49590 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HARS2P49590 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HARS2P49590 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HARS2P49590 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HARS2P49590 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HARS2P49590 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HARS2P49590 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HARS2P49590 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HARS2P49590 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HARS2P49590 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HARS2P49590 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HARS2P49590 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HARS2P49590 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HARS2P49590 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HARS2P49590 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HARS2P49590 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HARS2P49590 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HARS2P49590 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HARS2P49590 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HARS2P49590 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HARS2P49590 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HARS2P49590 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HARS2P49590 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HARS2P49590 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARS2P49590 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARS2P49590 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HARS2P49590 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HARS2P49590 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HARS2P49590 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms