Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XCR1P46094 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XCR1P46094 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XCR1P46094 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XCR1P46094 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XCR1P46094 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XCR1P46094 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XCR1P46094 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XCR1P46094 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XCR1P46094 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XCR1P46094 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XCR1P46094 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XCR1P46094 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XCR1P46094 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XCR1P46094 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XCR1P46094 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XCR1P46094 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XCR1P46094 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XCR1P46094 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XCR1P46094 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XCR1P46094 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XCR1P46094 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XCR1P46094 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XCR1P46094 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XCR1P46094 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XCR1P46094 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XCR1P46094 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XCR1P46094 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XCR1P46094 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XCR1P46094 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XCR1P46094 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XCR1P46094 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XCR1P46094 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XCR1P46094 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XCR1P46094 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XCR1P46094 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XCR1P46094 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XCR1P46094 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XCR1P46094 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XCR1P46094 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XCR1P46094 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XCR1P46094 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XCR1P46094 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XCR1P46094 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XCR1P46094 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XCR1P46094 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XCR1P46094 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XCR1P46094 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XCR1P46094 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XCR1P46094 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XCR1P46094 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XCR1P46094 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XCR1P46094 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XCR1P46094 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XCR1P46094 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XCR1P46094 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XCR1P46094 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XCR1P46094 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XCR1P46094 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XCR1P46094 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XCR1P46094 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XCR1P46094 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XCR1P46094 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XCR1P46094 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XCR1P46094 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XCR1P46094 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XCR1P46094 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XCR1P46094 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XCR1P46094 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XCR1P46094 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XCR1P46094 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XCR1P46094 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XCR1P46094 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XCR1P46094 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XCR1P46094 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XCR1P46094 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XCR1P46094 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XCR1P46094 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XCR1P46094 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XCR1P46094 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XCR1P46094 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XCR1P46094 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XCR1P46094 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XCR1P46094 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XCR1P46094 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XCR1P46094 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XCR1P46094 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XCR1P46094 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XCR1P46094 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XCR1P46094 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XCR1P46094 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XCR1P46094 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XCR1P46094 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XCR1P46094 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms