Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PI4KAP42356 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PI4KAP42356 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PI4KAP42356 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PI4KAP42356 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4KAP42356 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms