Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TXLNAP40222 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXLNAP40222 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TXLNAP40222 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TXLNAP40222 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TXLNAP40222 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms