Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FEN1P39748 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FEN1P39748 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FEN1P39748 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FEN1P39748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FEN1P39748 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEN1P39748 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEN1P39748 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEN1P39748 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FEN1P39748 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FEN1P39748 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FEN1P39748 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEN1P39748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEN1P39748 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEN1P39748 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FEN1P39748 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEN1P39748 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEN1P39748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEN1P39748 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEN1P39748 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FEN1P39748 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FEN1P39748 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FEN1P39748 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FEN1P39748 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FEN1P39748 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FEN1P39748 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FEN1P39748 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FEN1P39748 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FEN1P39748 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FEN1P39748 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FEN1P39748 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FEN1P39748 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FEN1P39748 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FEN1P39748 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FEN1P39748 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FEN1P39748 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FEN1P39748 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FEN1P39748 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FEN1P39748 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FEN1P39748 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FEN1P39748 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FEN1P39748 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FEN1P39748 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FEN1P39748 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FEN1P39748 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FEN1P39748 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FEN1P39748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FEN1P39748 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FEN1P39748 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FEN1P39748 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FEN1P39748 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FEN1P39748 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FEN1P39748 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FEN1P39748 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FEN1P39748 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FEN1P39748 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FEN1P39748 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FEN1P39748 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FEN1P39748 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FEN1P39748 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FEN1P39748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FEN1P39748 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FEN1P39748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FEN1P39748 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FEN1P39748 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FEN1P39748 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FEN1P39748 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FEN1P39748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FEN1P39748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FEN1P39748 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FEN1P39748 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FEN1P39748 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FEN1P39748 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FEN1P39748 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FEN1P39748 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FEN1P39748 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FEN1P39748 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FEN1P39748 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FEN1P39748 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FEN1P39748 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FEN1P39748 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FEN1P39748 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FEN1P39748 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FEN1P39748 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FEN1P39748 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FEN1P39748 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FEN1P39748 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FEN1P39748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FEN1P39748 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FEN1P39748 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FEN1P39748 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FEN1P39748 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FEN1P39748 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FEN1P39748 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FEN1P39748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FEN1P39748 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FEN1P39748 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FEN1P39748 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FEN1P39748 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FEN1P39748 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms