Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL4P36578 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL4P36578 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL4P36578 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL4P36578 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL4P36578 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL4P36578 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL4P36578 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL4P36578 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL4P36578 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL4P36578 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL4P36578 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL4P36578 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL4P36578 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL4P36578 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL4P36578 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL4P36578 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL4P36578 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL4P36578 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL4P36578 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL4P36578 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL4P36578 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL4P36578 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL4P36578 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL4P36578 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL4P36578 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL4P36578 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL4P36578 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL4P36578 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL4P36578 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL4P36578 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL4P36578 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL4P36578 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL4P36578 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL4P36578 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL4P36578 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL4P36578 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL4P36578 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL4P36578 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL4P36578 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL4P36578 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL4P36578 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL4P36578 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL4P36578 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL4P36578 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL4P36578 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL4P36578 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL4P36578 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL4P36578 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL4P36578 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL4P36578 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL4P36578 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL4P36578 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL4P36578 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL4P36578 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL4P36578 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL4P36578 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL4P36578 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL4P36578 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL4P36578 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL4P36578 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL4P36578 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL4P36578 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL4P36578 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL4P36578 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL4P36578 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL4P36578 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL4P36578 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL4P36578 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL4P36578 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL4P36578 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL4P36578 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL4P36578 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL4P36578 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL4P36578 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL4P36578 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL4P36578 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL4P36578 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL4P36578 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL4P36578 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL4P36578 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL4P36578 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL4P36578 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL4P36578 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL4P36578 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL4P36578 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL4P36578 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL4P36578 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL4P36578 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL4P36578 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL4P36578 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL4P36578 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL4P36578 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL4P36578 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL4P36578 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL4P36578 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL4P36578 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL4P36578 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL4P36578 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL4P36578 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms