Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP5C1P36542 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP5C1P36542 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP5C1P36542 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5C1P36542 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5C1P36542 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5C1P36542 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP5C1P36542 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP5C1P36542 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP5C1P36542 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5C1P36542 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP5C1P36542 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP5C1P36542 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP5C1P36542 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP5C1P36542 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5C1P36542 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5C1P36542 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5C1P36542 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5C1P36542 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5C1P36542 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP5C1P36542 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP5C1P36542 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP5C1P36542 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP5C1P36542 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP5C1P36542 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP5C1P36542 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP5C1P36542 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP5C1P36542 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP5C1P36542 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP5C1P36542 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP5C1P36542 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP5C1P36542 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP5C1P36542 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms