Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM23P36406 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM23P36406 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM23P36406 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM23P36406 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM23P36406 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms