Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLCN1P35523 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLCN1P35523 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLCN1P35523 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CLCN1P35523 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLCN1P35523 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLCN1P35523 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLCN1P35523 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLCN1P35523 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLCN1P35523 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLCN1P35523 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLCN1P35523 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLCN1P35523 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLCN1P35523 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLCN1P35523 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLCN1P35523 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLCN1P35523 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms