Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER4P35408 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER4P35408 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGER4P35408 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER4P35408 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER4P35408 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms