Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRS3P32247 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRS3P32247 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRS3P32247 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRS3P32247 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRS3P32247 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRS3P32247 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRS3P32247 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRS3P32247 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRS3P32247 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRS3P32247 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRS3P32247 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRS3P32247 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRS3P32247 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRS3P32247 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRS3P32247 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRS3P32247 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRS3P32247 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BRS3P32247 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRS3P32247 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRS3P32247 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRS3P32247 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRS3P32247 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRS3P32247 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRS3P32247 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRS3P32247 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRS3P32247 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRS3P32247 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRS3P32247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRS3P32247 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRS3P32247 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRS3P32247 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRS3P32247 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRS3P32247 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRS3P32247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRS3P32247 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRS3P32247 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRS3P32247 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRS3P32247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRS3P32247 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRS3P32247 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRS3P32247 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRS3P32247 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRS3P32247 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRS3P32247 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRS3P32247 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BRS3P32247 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRS3P32247 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRS3P32247 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRS3P32247 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRS3P32247 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRS3P32247 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRS3P32247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRS3P32247 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRS3P32247 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRS3P32247 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRS3P32247 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRS3P32247 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRS3P32247 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRS3P32247 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRS3P32247 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRS3P32247 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRS3P32247 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRS3P32247 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRS3P32247 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRS3P32247 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRS3P32247 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRS3P32247 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRS3P32247 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRS3P32247 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRS3P32247 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRS3P32247 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRS3P32247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRS3P32247 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRS3P32247 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRS3P32247 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRS3P32247 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRS3P32247 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRS3P32247 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRS3P32247 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRS3P32247 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRS3P32247 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRS3P32247 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRS3P32247 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRS3P32247 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRS3P32247 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRS3P32247 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRS3P32247 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRS3P32247 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRS3P32247 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRS3P32247 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRS3P32247 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRS3P32247 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRS3P32247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRS3P32247 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRS3P32247 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRS3P32247 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRS3P32247 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRS3P32247 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRS3P32247 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms