Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC13P31276 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC13P31276 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC13P31276 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC13P31276 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC13P31276 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC13P31276 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC13P31276 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC13P31276 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXC13P31276 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC13P31276 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC13P31276 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC13P31276 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC13P31276 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC13P31276 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC13P31276 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC13P31276 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC13P31276 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC13P31276 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC13P31276 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC13P31276 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC13P31276 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC13P31276 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC13P31276 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC13P31276 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC13P31276 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC13P31276 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC13P31276 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC13P31276 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC13P31276 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC13P31276 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXC13P31276 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXC13P31276 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms