Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB4P30926 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB4P30926 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB4P30926 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB4P30926 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1640.5 ms