Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHC1P29353 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC1P29353 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC1P29353 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHC1P29353 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHC1P29353 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC1P29353 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHC1P29353 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC1P29353 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHC1P29353 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC1P29353 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHC1P29353 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC1P29353 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHC1P29353 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC1P29353 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC1P29353 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC1P29353 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC1P29353 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC1P29353 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC1P29353 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC1P29353 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC1P29353 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC1P29353 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC1P29353 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC1P29353 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC1P29353 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC1P29353 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC1P29353 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC1P29353 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC1P29353 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC1P29353 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC1P29353 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC1P29353 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC1P29353 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC1P29353 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC1P29353 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC1P29353 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC1P29353 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHC1P29353 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC1P29353 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC1P29353 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC1P29353 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC1P29353 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC1P29353 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC1P29353 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC1P29353 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC1P29353 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC1P29353 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC1P29353 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC1P29353 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC1P29353 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC1P29353 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC1P29353 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC1P29353 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC1P29353 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC1P29353 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC1P29353 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC1P29353 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC1P29353 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHC1P29353 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC1P29353 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHC1P29353 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHC1P29353 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHC1P29353 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHC1P29353 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHC1P29353 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHC1P29353 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHC1P29353 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHC1P29353 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHC1P29353 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHC1P29353 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHC1P29353 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHC1P29353 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHC1P29353 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHC1P29353 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHC1P29353 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHC1P29353 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHC1P29353 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHC1P29353 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHC1P29353 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHC1P29353 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHC1P29353 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHC1P29353 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHC1P29353 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHC1P29353 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHC1P29353 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHC1P29353 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHC1P29353 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHC1P29353 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHC1P29353 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHC1P29353 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHC1P29353 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHC1P29353 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHC1P29353 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHC1P29353 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHC1P29353 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHC1P29353 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHC1P29353 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHC1P29353 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHC1P29353 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms