Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms