Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSSP25774 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSSP25774 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSSP25774 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSSP25774 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSSP25774 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSSP25774 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSSP25774 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSSP25774 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSSP25774 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSSP25774 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSSP25774 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSSP25774 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSSP25774 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSSP25774 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSSP25774 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSSP25774 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSSP25774 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSSP25774 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSSP25774 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSSP25774 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSSP25774 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSSP25774 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSSP25774 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSSP25774 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSSP25774 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSSP25774 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSSP25774 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSSP25774 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSSP25774 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSSP25774 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSSP25774 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSSP25774 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSSP25774 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSSP25774 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSSP25774 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSSP25774 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSSP25774 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSSP25774 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSSP25774 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSSP25774 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSSP25774 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSSP25774 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSSP25774 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSSP25774 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSSP25774 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSSP25774 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSSP25774 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSSP25774 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSSP25774 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSSP25774 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSSP25774 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSSP25774 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSSP25774 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSSP25774 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSSP25774 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSSP25774 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSSP25774 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSSP25774 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSSP25774 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSSP25774 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSSP25774 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSSP25774 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSSP25774 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSSP25774 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSSP25774 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSSP25774 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSSP25774 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSSP25774 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSSP25774 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSSP25774 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSSP25774 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSSP25774 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSSP25774 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSSP25774 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSSP25774 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSSP25774 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSSP25774 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSSP25774 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSSP25774 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSSP25774 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSSP25774 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSSP25774 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSSP25774 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSSP25774 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSSP25774 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSSP25774 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSSP25774 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSSP25774 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSSP25774 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSSP25774 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSSP25774 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSSP25774 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSSP25774 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSSP25774 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSSP25774 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSSP25774 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSSP25774 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSSP25774 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSSP25774 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms