Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR1P25024 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR1P25024 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR1P25024 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR1P25024 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR1P25024 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR1P25024 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR1P25024 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR1P25024 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXCR1P25024 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCR1P25024 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCR1P25024 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR1P25024 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms