Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK2P24941 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK2P24941 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK2P24941 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK2P24941 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK2P24941 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK2P24941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK2P24941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK2P24941 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK2P24941 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK2P24941 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK2P24941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK2P24941 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK2P24941 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK2P24941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK2P24941 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK2P24941 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK2P24941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK2P24941 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK2P24941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK2P24941 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK2P24941 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK2P24941 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK2P24941 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK2P24941 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK2P24941 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK2P24941 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK2P24941 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK2P24941 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK2P24941 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK2P24941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK2P24941 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK2P24941 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK2P24941 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK2P24941 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK2P24941 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK2P24941 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK2P24941 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK2P24941 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK2P24941 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK2P24941 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK2P24941 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK2P24941 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK2P24941 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK2P24941 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK2P24941 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK2P24941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK2P24941 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK2P24941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK2P24941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK2P24941 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK2P24941 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK2P24941 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK2P24941 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK2P24941 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK2P24941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK2P24941 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK2P24941 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK2P24941 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK2P24941 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK2P24941 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK2P24941 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK2P24941 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK2P24941 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK2P24941 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK2P24941 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK2P24941 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK2P24941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK2P24941 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK2P24941 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK2P24941 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK2P24941 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK2P24941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK2P24941 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK2P24941 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK2P24941 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK2P24941 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK2P24941 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK2P24941 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK2P24941 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK2P24941 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK2P24941 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK2P24941 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK2P24941 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK2P24941 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK2P24941 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK2P24941 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2P24941 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK2P24941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK2P24941 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK2P24941 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK2P24941 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK2P24941 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK2P24941 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK2P24941 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK2P24941 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK2P24941 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2P24941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2P24941 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK2P24941 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms