Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR1P24046 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRR1P24046 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR1P24046 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRR1P24046 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRR1P24046 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRR1P24046 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR1P24046 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms