Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SP100P23497 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SP100P23497 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SP100P23497 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP100P23497 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP100P23497 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP100P23497 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP100P23497 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP100P23497 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP100P23497 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP100P23497 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP100P23497 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP100P23497 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP100P23497 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP100P23497 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP100P23497 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP100P23497 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SP100P23497 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SP100P23497 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SP100P23497 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP100P23497 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP100P23497 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP100P23497 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP100P23497 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP100P23497 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SP100P23497 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SP100P23497 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SP100P23497 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SP100P23497 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP100P23497 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP100P23497 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP100P23497 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SP100P23497 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP100P23497 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP100P23497 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP100P23497 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP100P23497 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SP100P23497 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SP100P23497 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP100P23497 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP100P23497 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SP100P23497 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SP100P23497 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SP100P23497 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SP100P23497 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SP100P23497 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SP100P23497 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SP100P23497 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP100P23497 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP100P23497 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP100P23497 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP100P23497 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP100P23497 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP100P23497 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP100P23497 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP100P23497 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP100P23497 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP100P23497 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SP100P23497 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP100P23497 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP100P23497 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP100P23497 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP100P23497 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP100P23497 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP100P23497 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP100P23497 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP100P23497 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SP100P23497 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP100P23497 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP100P23497 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP100P23497 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP100P23497 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP100P23497 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP100P23497 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP100P23497 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP100P23497 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP100P23497 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP100P23497 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP100P23497 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP100P23497 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP100P23497 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP100P23497 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP100P23497 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP100P23497 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP100P23497 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP100P23497 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP100P23497 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP100P23497 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP100P23497 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP100P23497 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP100P23497 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP100P23497 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP100P23497 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP100P23497 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP100P23497 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP100P23497 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP100P23497 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SP100P23497 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP100P23497 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP100P23497 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms