Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPD1P23109 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AMPD1P23109 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AMPD1P23109 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AMPD1P23109 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AMPD1P23109 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AMPD1P23109 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AMPD1P23109 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPD1P23109 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AMPD1P23109 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AMPD1P23109 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AMPD1P23109 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AMPD1P23109 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AMPD1P23109 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms