Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHCGRP22888 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHCGRP22888 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHCGRP22888 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHCGRP22888 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHCGRP22888 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHCGRP22888 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHCGRP22888 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LHCGRP22888 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHCGRP22888 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LHCGRP22888 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms