Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NR1D1P20393 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR1D1P20393 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR1D1P20393 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR1D1P20393 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR1D1P20393 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D1P20393 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms