Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3BP20337 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3BP20337 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RAB3BP20337 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3BP20337 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3BP20337 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3BP20337 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3BP20337 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms