Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRM3P20309 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM3P20309 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRM3P20309 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRM3P20309 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRM3P20309 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRM3P20309 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms