Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABRB1P18505 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB1P18505 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB1P18505 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB1P18505 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB1P18505 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRB1P18505 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB1P18505 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB1P18505 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms