Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF3P17036 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF3P17036 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF3P17036 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF3P17036 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF3P17036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF3P17036 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF3P17036 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms