Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSPP15924 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DSPP15924 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSPP15924 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSPP15924 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSPP15924 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSPP15924 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DSPP15924 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSPP15924 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSPP15924 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSPP15924 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSPP15924 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSPP15924 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSPP15924 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSPP15924 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSPP15924 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSPP15924 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSPP15924 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSPP15924 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSPP15924 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSPP15924 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSPP15924 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSPP15924 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSPP15924 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSPP15924 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSPP15924 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSPP15924 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSPP15924 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSPP15924 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSPP15924 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSPP15924 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSPP15924 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSPP15924 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSPP15924 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSPP15924 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
DSPP15924 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSPP15924 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSPP15924 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSPP15924 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DSPP15924 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSPP15924 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSPP15924 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSPP15924 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSPP15924 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DSPP15924 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSPP15924 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSPP15924 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSPP15924 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSPP15924 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSPP15924 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSPP15924 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DSPP15924 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSPP15924 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSPP15924 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSPP15924 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSPP15924 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSPP15924 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DSPP15924 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSPP15924 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSPP15924 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSPP15924 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSPP15924 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSPP15924 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSPP15924 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSPP15924 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSPP15924 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DSPP15924 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DSPP15924 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSPP15924 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSPP15924 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSPP15924 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSPP15924 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSPP15924 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSPP15924 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSPP15924 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSPP15924 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSPP15924 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DSPP15924 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSPP15924 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSPP15924 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSPP15924 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DSPP15924 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSPP15924 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSPP15924 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSPP15924 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSPP15924 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSPP15924 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSPP15924 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms