Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT5P13647 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT5P13647 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT5P13647 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT5P13647 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT5P13647 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT5P13647 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT5P13647 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT5P13647 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT5P13647 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT5P13647 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT5P13647 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT5P13647 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT5P13647 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT5P13647 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT5P13647 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT5P13647 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT5P13647 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT5P13647 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT5P13647 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT5P13647 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT5P13647 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT5P13647 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT5P13647 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT5P13647 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT5P13647 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT5P13647 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT5P13647 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT5P13647 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT5P13647 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT5P13647 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT5P13647 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT5P13647 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT5P13647 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT5P13647 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT5P13647 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT5P13647 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT5P13647 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT5P13647 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT5P13647 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT5P13647 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT5P13647 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT5P13647 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT5P13647 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT5P13647 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT5P13647 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT5P13647 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT5P13647 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT5P13647 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT5P13647 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT5P13647 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT5P13647 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT5P13647 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT5P13647 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT5P13647 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT5P13647 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT5P13647 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT5P13647 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT5P13647 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT5P13647 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT5P13647 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT5P13647 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT5P13647 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT5P13647 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT5P13647 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT5P13647 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT5P13647 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT5P13647 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT5P13647 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT5P13647 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT5P13647 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT5P13647 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT5P13647 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT5P13647 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT5P13647 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT5P13647 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT5P13647 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT5P13647 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT5P13647 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KRT5P13647 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT5P13647 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT5P13647 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT5P13647 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT5P13647 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT5P13647 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT5P13647 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT5P13647 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT5P13647 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT5P13647 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT5P13647 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT5P13647 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT5P13647 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms