Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CKBP12277 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CKBP12277 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CKBP12277 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CKBP12277 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKBP12277 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKBP12277 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKBP12277 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKBP12277 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKBP12277 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKBP12277 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKBP12277 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CKBP12277 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CKBP12277 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CKBP12277 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CKBP12277 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CKBP12277 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CKBP12277 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CKBP12277 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CKBP12277 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CKBP12277 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CKBP12277 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CKBP12277 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CKBP12277 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CKBP12277 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CKBP12277 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CKBP12277 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CKBP12277 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CKBP12277 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CKBP12277 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CKBP12277 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CKBP12277 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CKBP12277 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CKBP12277 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CKBP12277 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CKBP12277 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CKBP12277 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CKBP12277 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CKBP12277 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CKBP12277 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CKBP12277 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CKBP12277 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CKBP12277 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CKBP12277 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CKBP12277 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CKBP12277 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CKBP12277 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CKBP12277 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CKBP12277 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CKBP12277 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CKBP12277 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CKBP12277 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CKBP12277 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CKBP12277 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CKBP12277 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CKBP12277 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CKBP12277 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CKBP12277 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CKBP12277 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CKBP12277 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CKBP12277 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CKBP12277 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKBP12277 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKBP12277 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKBP12277 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CKBP12277 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKBP12277 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKBP12277 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKBP12277 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKBP12277 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKBP12277 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CKBP12277 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CKBP12277 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CKBP12277 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CKBP12277 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKBP12277 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKBP12277 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKBP12277 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKBP12277 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CKBP12277 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CKBP12277 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKBP12277 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKBP12277 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CKBP12277 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CKBP12277 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CKBP12277 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CKBP12277 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKBP12277 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKBP12277 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKBP12277 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CKBP12277 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKBP12277 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKBP12277 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKBP12277 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKBP12277 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKBP12277 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKBP12277 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKBP12277 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKBP12277 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKBP12277 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms