Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HARSP12081 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HARSP12081 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HARSP12081 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HARSP12081 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HARSP12081 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HARSP12081 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HARSP12081 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HARSP12081 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HARSP12081 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HARSP12081 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HARSP12081 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HARSP12081 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HARSP12081 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HARSP12081 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HARSP12081 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HARSP12081 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
HARSP12081 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HARSP12081 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HARSP12081 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HARSP12081 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HARSP12081 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HARSP12081 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HARSP12081 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HARSP12081 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HARSP12081 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HARSP12081 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HARSP12081 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HARSP12081 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HARSP12081 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HARSP12081 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HARSP12081 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HARSP12081 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HARSP12081 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HARSP12081 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HARSP12081 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HARSP12081 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HARSP12081 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HARSP12081 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HARSP12081 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HARSP12081 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HARSP12081 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HARSP12081 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HARSP12081 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HARSP12081 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HARSP12081 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HARSP12081 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HARSP12081 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HARSP12081 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HARSP12081 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HARSP12081 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HARSP12081 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HARSP12081 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HARSP12081 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HARSP12081 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HARSP12081 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HARSP12081 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HARSP12081 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HARSP12081 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HARSP12081 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HARSP12081 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HARSP12081 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HARSP12081 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HARSP12081 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HARSP12081 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HARSP12081 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HARSP12081 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HARSP12081 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HARSP12081 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HARSP12081 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HARSP12081 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HARSP12081 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HARSP12081 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HARSP12081 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HARSP12081 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HARSP12081 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HARSP12081 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HARSP12081 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HARSP12081 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HARSP12081 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HARSP12081 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HARSP12081 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HARSP12081 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HARSP12081 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HARSP12081 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HARSP12081 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HARSP12081 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HARSP12081 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HARSP12081 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HARSP12081 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HARSP12081 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HARSP12081 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HARSP12081 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HARSP12081 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HARSP12081 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HARSP12081 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HARSP12081 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HARSP12081 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HARSP12081 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HARSP12081 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms