Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK4P11802 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK4P11802 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK4P11802 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK4P11802 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK4P11802 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK4P11802 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK4P11802 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK4P11802 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK4P11802 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK4P11802 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK4P11802 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK4P11802 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK4P11802 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK4P11802 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK4P11802 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK4P11802 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK4P11802 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK4P11802 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK4P11802 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK4P11802 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK4P11802 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK4P11802 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK4P11802 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK4P11802 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK4P11802 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK4P11802 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK4P11802 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK4P11802 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK4P11802 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK4P11802 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK4P11802 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK4P11802 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK4P11802 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK4P11802 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK4P11802 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK4P11802 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK4P11802 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK4P11802 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK4P11802 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK4P11802 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK4P11802 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK4P11802 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK4P11802 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK4P11802 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK4P11802 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK4P11802 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK4P11802 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK4P11802 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK4P11802 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK4P11802 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK4P11802 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK4P11802 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK4P11802 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK4P11802 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK4P11802 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK4P11802 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK4P11802 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK4P11802 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK4P11802 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK4P11802 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK4P11802 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK4P11802 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK4P11802 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK4P11802 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK4P11802 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK4P11802 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK4P11802 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK4P11802 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK4P11802 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK4P11802 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK4P11802 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK4P11802 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK4P11802 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK4P11802 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK4P11802 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK4P11802 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK4P11802 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK4P11802 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK4P11802 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK4P11802 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK4P11802 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK4P11802 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK4P11802 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK4P11802 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK4P11802 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK4P11802 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK4P11802 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK4P11802 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK4P11802 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK4P11802 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK4P11802 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK4P11802 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK4P11802 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK4P11802 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK4P11802 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK4P11802 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK4P11802 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK4P11802 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK4P11802 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms