Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
U2AF1L5P0DN76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
U2AF1L5P0DN76 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
U2AF1L5P0DN76 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
U2AF1L5P0DN76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
U2AF1L5P0DN76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
U2AF1L5P0DN76 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
U2AF1L5P0DN76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
U2AF1L5P0DN76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
U2AF1L5P0DN76 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
U2AF1L5P0DN76 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
U2AF1L5P0DN76 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
U2AF1L5P0DN76 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms