Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP2CP0DJJ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP2CP0DJJ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP2CP0DJJ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP2CP0DJJ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP2CP0DJJ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP2CP0DJJ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms