Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM6P0DI80 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMIM6P0DI80 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM6P0DI80 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM6P0DI80 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM6P0DI80 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM6P0DI80 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM6P0DI80 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms