Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PNMA6AP0CW24 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA6AP0CW24 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA6AP0CW24 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA6AP0CW24 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA6AP0CW24 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNMA6AP0CW24 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNMA6AP0CW24 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms