Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms