Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PABPC4LP0CB38 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PABPC4LP0CB38 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PABPC4LP0CB38 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PABPC4LP0CB38 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC4LP0CB38 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC4LP0CB38 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms