Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
C4AP0C0L4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
C4AP0C0L4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
C4AP0C0L4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
C4AP0C0L4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
C4AP0C0L4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
C4AP0C0L4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
C4AP0C0L4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
C4AP0C0L4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
C4AP0C0L4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
C4AP0C0L4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
C4AP0C0L4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
C4AP0C0L4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
C4AP0C0L4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C4AP0C0L4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C4AP0C0L4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms