Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTAP09496 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTAP09496 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTAP09496 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTAP09496 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTAP09496 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTAP09496 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLTAP09496 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTAP09496 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTAP09496 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTAP09496 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTAP09496 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTAP09496 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTAP09496 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTAP09496 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTAP09496 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTAP09496 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTAP09496 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTAP09496 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTAP09496 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTAP09496 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTAP09496 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTAP09496 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTAP09496 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTAP09496 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTAP09496 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTAP09496 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTAP09496 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTAP09496 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTAP09496 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTAP09496 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTAP09496 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTAP09496 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTAP09496 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTAP09496 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLTAP09496 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTAP09496 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTAP09496 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTAP09496 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLTAP09496 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTAP09496 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTAP09496 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLTAP09496 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTAP09496 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTAP09496 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTAP09496 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTAP09496 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTAP09496 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTAP09496 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTAP09496 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTAP09496 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTAP09496 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTAP09496 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTAP09496 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTAP09496 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTAP09496 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTAP09496 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTAP09496 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTAP09496 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTAP09496 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTAP09496 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTAP09496 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTAP09496 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLTAP09496 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLTAP09496 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTAP09496 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTAP09496 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTAP09496 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTAP09496 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLTAP09496 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLTAP09496 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTAP09496 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTAP09496 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLTAP09496 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTAP09496 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTAP09496 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTAP09496 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTAP09496 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTAP09496 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTAP09496 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTAP09496 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTAP09496 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTAP09496 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTAP09496 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTAP09496 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTAP09496 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTAP09496 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTAP09496 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTAP09496 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTAP09496 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTAP09496 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTAP09496 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTAP09496 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms